常州市第二人民医院始建于1943年，前身为武进县立医院，1946年更名为武进公立医院，1950年更名为常州市康复医院，1956年更名为常州市第二人民医院，2000年成为南京医科大学附属医院。经过70年的建设，常州市第二人民医院现已发展成为一所科室设置齐全、技术力量雄厚、医疗设备先进、学术水平较高，集医疗、教学、科研、预防为一体的现代化三级甲等综合性医院，并曾先后荣获“全国精神文明建设工作先进单位”、“江苏省文明单位”、“江苏省五一劳动奖章”、“市文明标兵单位”等称号。
为加快医院建设，根据市政府的统一规划，经过四年努力，2012年1月，又一座现代化的三级甲等综合医院——常州二院阳湖院区在武进新城区强势崛起。阳湖院区位于武进区政府南面，常州大学城之北，占地面积220亩，设计总建筑面积28万m2，一期完成18万m2，设计床位2500张，一期开放800张，阳湖院区完全按照三级甲等医院标准设计建成，是集园林式、高新、专业、低碳、无烟、抗震能力强为一体的现代化医院。阳湖医院的启用，为我市特别是武进及周边地区的广大市民群众提供了又一处良好的就医环境和优质的医疗服务。
截止2012年，医院(两个院区)总占地面积280亩，总建筑面积近25万平方米，开放床位1740张，有职工约2300余人，其中高级职称310人，中级职称516人，博士、硕士学位289人，教授、副教授37人。拥有博士生培养点1个，硕士生培养点12个，博士生、硕士生导师56人，江苏省医学创新团队1个(内分泌科)，江苏省医学领军人才1名，江苏省医学重点人才1名，江苏省医学重点人才(联合共建)1名。2012年完成门急诊总量157万人次，出院病人50345人次，完成手术30270例次。
医院设有临床科室和医技科室49个，内分泌内科、骨外科、胸心外科、肿瘤内科、放射治疗科、心血管内科为省级临床重点专科;市临床重点专科25个;市级医学重点学科3个;市级重点实验室1个。先后建立了常州市糖尿病研究所、院肿瘤研究所、院骨科临床研究所，与常州大学合作创办了常州大学护理学院。